More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0101 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.65 
 
 
389 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.61 
 
 
388 aa  554  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  63.08 
 
 
390 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  62.82 
 
 
390 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.72 
 
 
387 aa  465  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.96 
 
 
391 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.38 
 
 
395 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  49.1 
 
 
387 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.36 
 
 
387 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.59 
 
 
387 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.84 
 
 
387 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  48.59 
 
 
387 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.36 
 
 
387 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
387 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.07 
 
 
387 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 
387 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 
385 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
387 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
390 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  49.35 
 
 
394 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
387 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.47 
 
 
397 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 
390 aa  358  7e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
396 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  44.64 
 
 
391 aa  342  5.999999999999999e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 
390 aa  338  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.84 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
395 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.52 
 
 
379 aa  333  3e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  43.28 
 
 
402 aa  331  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.18 
 
 
392 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 
385 aa  322  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  43.65 
 
 
395 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 
395 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  40.76 
 
 
399 aa  296  3e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
384 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  41.78 
 
 
381 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  40.26 
 
 
385 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
388 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
395 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
384 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 
390 aa  288  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  39.2 
 
 
396 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
395 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  40.22 
 
 
395 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  41.11 
 
 
381 aa  279  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.13 
 
 
393 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  39.8 
 
 
381 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 
382 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  38.24 
 
 
387 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  38.24 
 
 
387 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  37.97 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.8 
 
 
383 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  38.4 
 
 
387 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  38.13 
 
 
387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  38.13 
 
 
387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  38.13 
 
 
387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
386 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  37.7 
 
 
387 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 
387 aa  269  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.13 
 
 
387 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.03 
 
 
382 aa  263  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
387 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 
395 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
513 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.7 
 
 
385 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
540 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.08 
 
 
521 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
382 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
386 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
385 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0070  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>