More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0842 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  97.95 
 
 		 390 aa  782    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  100 
 
 		 390 aa  796    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.01 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.82 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.23 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.06 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.53 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.74 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  50 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.74 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.74 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  49.49 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  49.49 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.23 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.46 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.8 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.69 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 		 387 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  45.62 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  44.19 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.11 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  42.36 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.36 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.32 
 
 		 397 aa  312  4.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  41.94 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.99 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 		 386 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 393 aa  278  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.34 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  39.9 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  40.31 
 
 		 381 aa  276  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  40.86 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  38.79 
 
 		 399 aa  269  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.42 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.98 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.29 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.29 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.43 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  37.07 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.43 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.61 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.43 
 
 		 540 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.43 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.22 
 
 		 521 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.22 
 
 		 513 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3566  NADH-dependent butanol dehydrogenase A, C-terminus  47.51 
 
 		 270 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  39.69 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  35.46 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  36.2 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.64 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.76 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  35.95 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  35.47 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>