More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0106 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.49 
 
 
395 aa  793    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
395 aa  795    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.87 
 
 
385 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.46 
 
 
379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.51 
 
 
388 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.98 
 
 
382 aa  378  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
387 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
385 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  47.72 
 
 
381 aa  359  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.2 
 
 
382 aa  359  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  46.19 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.84 
 
 
389 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  44.33 
 
 
390 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  46.45 
 
 
381 aa  352  7e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  44.08 
 
 
390 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 
389 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.29 
 
 
387 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  43.54 
 
 
387 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  43.54 
 
 
387 aa  345  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 
387 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.54 
 
 
387 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.54 
 
 
387 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.04 
 
 
387 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 
387 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.29 
 
 
387 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
383 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
388 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  43.16 
 
 
395 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
387 aa  329  6e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  44.79 
 
 
341 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
388 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 
392 aa  315  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
390 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  41.96 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 
391 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
398 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
395 aa  299  7e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
395 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
402 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  39.8 
 
 
390 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
395 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.5 
 
 
391 aa  292  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  41.87 
 
 
399 aa  292  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3126  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.6 
 
 
389 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.28 
 
 
393 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  41.35 
 
 
385 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.59 
 
 
395 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
384 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
390 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 
390 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
395 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
382 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
382 aa  265  8e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  34.58 
 
 
396 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
384 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0640  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.16 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1094  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
382 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  36.8 
 
 
384 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  39 
 
 
381 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
385 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
396 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
385 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
385 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 
397 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 
385 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.97 
 
 
385 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
386 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
385 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  37.02 
 
 
387 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
386 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
385 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.94 
 
 
385 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
385 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
521 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
385 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
385 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  36.74 
 
 
387 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
385 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.11 
 
 
513 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
385 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.89 
 
 
385 aa  236  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
385 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.89 
 
 
385 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
385 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 
385 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>