More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1120 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 397 aa  821    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.47 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 		 389 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  42.57 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  42.32 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  39.8 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.8 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 396 aa  288  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 392 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  36.39 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 395 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 		 386 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  34.08 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.34 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.16 
 
 		 395 aa  229  8e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.84 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  33.84 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  35.75 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  33.59 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.14 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.08 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  35.2 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  34.09 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.85 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 513 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 540 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.7 
 
 		 521 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  34.95 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.49 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.49 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  32.41 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0070  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 		 387 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.98 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  33.89 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  32.23 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3126  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.74 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  31.11 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  31.96 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 		 387 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  31.87 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  31.87 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  31.87 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  31.87 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  31.87 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.86 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>