More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3004 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  75.71 
 
 
387 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  76.23 
 
 
387 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  76.23 
 
 
387 aa  634    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  799    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  76.23 
 
 
387 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  75.97 
 
 
387 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.6 
 
 
387 aa  721    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  75.19 
 
 
387 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  75.19 
 
 
387 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.71 
 
 
387 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.02 
 
 
388 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.33 
 
 
387 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3566  NADH-dependent butanol dehydrogenase A, C-terminus  73.88 
 
 
270 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.71 
 
 
385 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  53.51 
 
 
394 aa  408  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 
387 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 
389 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  47.95 
 
 
390 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  47.69 
 
 
390 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.41 
 
 
389 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.21 
 
 
391 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
390 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 
384 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  46.58 
 
 
399 aa  342  9e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  44.67 
 
 
395 aa  329  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 
379 aa  328  8e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
385 aa  325  8.000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.8 
 
 
395 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
395 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
395 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.37 
 
 
395 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  43.99 
 
 
385 aa  318  7.999999999999999e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  41.67 
 
 
396 aa  315  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
521 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.97 
 
 
540 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.58 
 
 
395 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.55 
 
 
386 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
385 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.85 
 
 
398 aa  299  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  42.31 
 
 
384 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
384 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
390 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
390 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
385 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 
393 aa  292  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.44 
 
 
385 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
385 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 
388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 
395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
385 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 
382 aa  286  5e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
382 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  40.26 
 
 
385 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
385 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.45 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.45 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.45 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.47 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
387 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
390 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3925  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
385 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
382 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.66 
 
 
385 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  40.38 
 
 
387 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  40.38 
 
 
387 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  40.11 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.27 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  40.33 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  40.11 
 
 
387 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 
386 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  40.11 
 
 
387 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
387 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  39.56 
 
 
387 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  40.23 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  39.29 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.62 
 
 
383 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>