More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0317 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
385 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
385 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
385 aa  775    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 
513 aa  1028    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  97.5 
 
 
521 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
385 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  99.61 
 
 
540 aa  1023    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  73.25 
 
 
385 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.97 
 
 
385 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.45 
 
 
385 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3925  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.19 
 
 
385 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
385 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.19 
 
 
385 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
385 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
385 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.97 
 
 
385 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.65 
 
 
386 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  64.68 
 
 
385 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
385 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.68 
 
 
385 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.03 
 
 
387 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  63.73 
 
 
387 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.16 
 
 
385 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  63.73 
 
 
387 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  64.16 
 
 
385 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  63.99 
 
 
387 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  64.16 
 
 
385 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  63.73 
 
 
387 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  63.47 
 
 
387 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.66 
 
 
387 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  63.99 
 
 
387 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.24 
 
 
384 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  63.73 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.47 
 
 
387 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.18 
 
 
387 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  63.24 
 
 
414 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.27 
 
 
387 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.66 
 
 
387 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.56 
 
 
385 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0070  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.17 
 
 
387 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.74 
 
 
384 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.22 
 
 
385 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.07 
 
 
389 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.22 
 
 
395 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  53.77 
 
 
385 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1035  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 
385 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00140437  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.4 
 
 
385 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1352  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.64 
 
 
410 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.9 
 
 
402 aa  432  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1013  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.64 
 
 
406 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  55.7 
 
 
383 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.29 
 
 
385 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 
386 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
386 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  50.26 
 
 
384 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
382 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 
381 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.96 
 
 
397 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  48.7 
 
 
382 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1094  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
382 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0640  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
382 aa  363  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
382 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
387 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
387 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3065  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
383 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514447  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.97 
 
 
387 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.97 
 
 
387 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.46 
 
 
387 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.97 
 
 
387 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
387 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  42.15 
 
 
394 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  38.72 
 
 
387 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.46 
 
 
387 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  38.72 
 
 
387 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
387 aa  276  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
385 aa  269  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 
391 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.38 
 
 
386 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
392 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
389 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.22 
 
 
390 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 
390 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
388 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
389 aa  253  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
388 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
387 aa  251  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  36.67 
 
 
390 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 
398 aa  249  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
385 aa  247  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
379 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
390 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>