More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1915 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 		 391 aa  802    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  53.33 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.67 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.08 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.62 
 
 		 385 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.45 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.21 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  47.19 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.94 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  46.43 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.43 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.17 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.68 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.17 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.66 
 
 		 387 aa  359  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.52 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.56 
 
 		 388 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.64 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  44.19 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  43 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  42.75 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  43 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  43.11 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  40.95 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  40.91 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.49 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  40.81 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  40.81 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  40.55 
 
 		 387 aa  282  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  41.8 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  40.87 
 
 		 385 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.28 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 385 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  38.93 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.65 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.19 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.65 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  38.68 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  38.68 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  38.68 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  38.68 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 540 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.34 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  37.66 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.57 
 
 		 382 aa  264  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 		 382 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0640  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.53 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.61 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 385 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 382 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  37.82 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  37 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>