169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1436 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  70.87 
 
 
255 aa  352  5e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  46.77 
 
 
256 aa  214  7e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  46.37 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  44.86 
 
 
257 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  31.09 
 
 
240 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.05 
 
 
234 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.66 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.64 
 
 
234 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  29.66 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.06 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.08 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.24 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.91 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.24 
 
 
229 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  29.03 
 
 
242 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  29.24 
 
 
229 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  29.24 
 
 
229 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.24 
 
 
229 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  28.81 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.81 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.24 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.13 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.49 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.21 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.45 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.46 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.39 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.39 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.22 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.22 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.03 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.54 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.38 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.8 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.53 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.96 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.8 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.69 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.34 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.33 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.73 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.55 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.28 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.88 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.57 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.73 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.87 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  30.35 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  28.03 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.7 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.36 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.52 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.99 
 
 
585 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.81 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.92 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.79 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  33.14 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.92 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.95 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.31 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.66 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.55 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.47 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.16 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.29 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.54 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.48 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.79 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.51 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  34.04 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5210  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.45 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.93 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  24.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.27 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.89 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.68 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.03 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.66 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.99 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.24 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.87 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.63 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0195  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.76 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  27.72 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.72 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  27.72 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.72 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>