153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0906 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  66.53 
 
 
256 aa  342  4e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  65.34 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  44.4 
 
 
255 aa  208  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  44.86 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  31.58 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.59 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.59 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.93 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  29.15 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  30.16 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.93 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.17 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.38 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.72 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.5 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.1 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.8 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.5 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.1 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.5 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.66 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.98 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.45 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.98 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  30.12 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  32.34 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  34.29 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  29.47 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  29.11 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  25.79 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  30.46 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.11 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  25.98 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.27 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.87 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  30.18 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.38 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.94 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.81 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.71 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.79 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.6 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  27.07 
 
 
331 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  28.52 
 
 
331 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.89 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.9 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  24.81 
 
 
332 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.67 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  26.77 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.46 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  22.44 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.77 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.46 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.77 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  26.87 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.31 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.8 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.77 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.26 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.57 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.44 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.75 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  25.19 
 
 
331 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  26.23 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0317  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.32 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.24 
 
 
241 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.26 
 
 
229 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  30.52 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.22 
 
 
264 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.95 
 
 
254 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.47 
 
 
242 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.57 
 
 
238 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.35 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1022  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.06 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.44 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  30.18 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.5 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.18 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.63 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.41 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.2 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1760  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.56 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.2 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.15 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.55 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.42 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.74 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1488  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.94 
 
 
585 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.45 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.16 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.42 
 
 
225 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  27.01 
 
 
652 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>