173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0343 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  96.86 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  66.53 
 
 
257 aa  342  4e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  43.95 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  46.77 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.35 
 
 
233 aa  85.5  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.33 
 
 
225 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.33 
 
 
225 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  30.37 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.15 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  31.84 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.67 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  31.01 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  29.64 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.63 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.36 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  31.84 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.97 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.97 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.35 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.73 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.9 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.33 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  30.21 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.2 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.73 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.21 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  30.21 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.73 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.35 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0506  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.07 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.273339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.36 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.98 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.78 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.92 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.38 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3083  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.31 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49935  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.88 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.1 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.21 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  29.17 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3702  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.41 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  26.87 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  31.95 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  26.05 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.17 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  27.41 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  27.31 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.74 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  24.81 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.4 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.59 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  25 
 
 
332 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.75 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  25.56 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.92 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0332  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.21 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000138371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.89 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.65 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.69 
 
 
227 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.59 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.5 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.17 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.32 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  29.92 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.5 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.5 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.95 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.33 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  32.39 
 
 
335 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  29.95 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.05 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.85 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.89 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  24.9 
 
 
330 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  22.54 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  25.1 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.11 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.19 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.83 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  32.02 
 
 
331 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.6 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  32.42 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2655  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.35 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  26.14 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.86 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1238  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.93 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.361113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.69 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.73 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.86 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.86 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.8 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  25.77 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.63 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1112  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.04 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1406  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.75 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>