More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0377 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0377  aspartate kinase  100 
 
 		 330 aa  665    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1840  aspartate kinase  76.15 
 
 		 327 aa  510  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0273  aspartate kinase  71.52 
 
 		 335 aa  501  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.558883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0958  aspartate kinase  71.12 
 
 		 329 aa  487  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.584504  normal  0.0145055 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1862  aspartate kinase  36.01 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  33.54 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1699  aspartate kinase  38.35 
 
 		 443 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.33468  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  38.31 
 
 		 823 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  35.11 
 
 		 468 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  34.75 
 
 		 468 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  35.11 
 
 		 468 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0009  aspartate kinase  33.1 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.743921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  34.15 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.45 
 
 		 817 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  34.86 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.32 
 
 		 819 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  34.15 
 
 		 465 aa  129  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  35.34 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.55 
 
 		 819 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  30.79 
 
 		 468 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  37.55 
 
 		 446 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  33.94 
 
 		 468 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.58 
 
 		 823 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.12 
 
 		 463 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  33.69 
 
 		 466 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  29.28 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  35.22 
 
 		 478 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  35.59 
 
 		 467 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.62 
 
 		 818 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  30.15 
 
 		 471 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  31.88 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  34.08 
 
 		 467 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  33.33 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  33.09 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  32.01 
 
 		 462 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3659  aspartate kinase I  38.74 
 
 		 409 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.142763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  29.77 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  34.82 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.4 
 
 		 815 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.72 
 
 		 818 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  29.3 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0641  aspartate kinase  30.27 
 
 		 437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.815981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  29.17 
 
 		 465 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  33.33 
 
 		 463 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28.77 
 
 		 471 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  32.78 
 
 		 452 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  30.87 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.77 
 
 		 820 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  32.31 
 
 		 541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  31.68 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  30.03 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  28.74 
 
 		 471 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  32.95 
 
 		 459 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.45 
 
 		 450 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.45 
 
 		 819 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  30.77 
 
 		 461 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  31.38 
 
 		 465 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  30.54 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1449  aspartate kinase, monofunctional class  39.9 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  30.1 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3550  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.12 
 
 		 797 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1940  aspartate kinase I  37.17 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.604323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  29.83 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  31.09 
 
 		 451 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08680  aspartate kinase  35.87 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  28.9 
 
 		 458 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.41 
 
 		 814 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  31.72 
 
 		 456 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  29.59 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1634  aspartate kinase I  37.85 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000370782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  28.24 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0616  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.13 
 
 		 813 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.13 
 
 		 822 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.81 
 
 		 815 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  29.53 
 
 		 469 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  32.12 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  31 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.82 
 
 		 834 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  28.81 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  30.72 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1282  aspartate kinase  28.15 
 
 		 489 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.94 
 
 		 835 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1090  aspartate kinase  38.1 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4055  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.42 
 
 		 797 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.27 
 
 		 835 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3438  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.42 
 
 		 797 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0513  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.42 
 
 		 797 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  31.3 
 
 		 451 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  31.94 
 
 		 451 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3613  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.66 
 
 		 797 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  31.94 
 
 		 451 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0521  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.97 
 
 		 797 aa  99.4  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  31.56 
 
 		 451 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3569  aspartate kinase I  38.64 
 
 		 410 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000141977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0537  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.37 
 
 		 797 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0565  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  29.37 
 
 		 797 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  29.79 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.94 
 
 		 835 aa  99  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3898  aspartate kinase I  35.68 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3837  aspartate kinase I  38.64 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000273355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>