More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0958 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0958  aspartate kinase  100 
 
 
329 aa  668    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.584504  normal  0.0145055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0273  aspartate kinase  73.78 
 
 
335 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.558883  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1840  aspartate kinase  73.93 
 
 
327 aa  494  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0377  aspartate kinase  71.12 
 
 
330 aa  475  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1862  aspartate kinase  37.19 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1699  aspartate kinase  34.06 
 
 
443 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.33468  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  32.6 
 
 
467 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.27 
 
 
819 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  39.43 
 
 
823 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.03 
 
 
817 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  32.57 
 
 
468 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  33.44 
 
 
471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  32.57 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  34.26 
 
 
472 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  30.06 
 
 
818 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  33.33 
 
 
468 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  31.89 
 
 
469 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.97 
 
 
450 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  32.89 
 
 
471 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  35.55 
 
 
478 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  32.24 
 
 
468 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0009  aspartate kinase  31.19 
 
 
377 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.743921  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.65 
 
 
819 aa  123  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  29.9 
 
 
450 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  34.45 
 
 
452 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  33.22 
 
 
469 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  33.22 
 
 
471 aa  122  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  29.93 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  33.67 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  33.22 
 
 
471 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  36.13 
 
 
451 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  30.95 
 
 
469 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  36.03 
 
 
451 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  36.03 
 
 
451 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  31 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  33.94 
 
 
446 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  36.13 
 
 
451 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  33.58 
 
 
459 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28 
 
 
471 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  30.17 
 
 
454 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.46 
 
 
818 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  35.41 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  32.12 
 
 
449 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  31.54 
 
 
461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  32.69 
 
 
451 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  32.06 
 
 
467 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  31.65 
 
 
461 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.09 
 
 
819 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  30.87 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.89 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.23 
 
 
815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  27.42 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  28.9 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  35.06 
 
 
451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  34.67 
 
 
449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  34.69 
 
 
451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  34.69 
 
 
451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4075  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.73 
 
 
810 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  31.06 
 
 
458 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  37.93 
 
 
466 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.64 
 
 
815 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  34.25 
 
 
462 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.27 
 
 
823 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.07 
 
 
449 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4045  aspartate kinase  32.36 
 
 
810 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4382  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.810334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5400  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.324557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4426  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4174  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  34.18 
 
 
451 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4480  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.27821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  34.18 
 
 
451 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03826  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.36 
 
 
810 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.087529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  31.62 
 
 
467 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03775  hypothetical protein  32.36 
 
 
810 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0902999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.16 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4785  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  32.5 
 
 
811 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  31.44 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  29.24 
 
 
465 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  31.45 
 
 
456 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4348  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.91 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  29.33 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4318  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.91 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4034  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  31.79 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.522954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4432  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.91 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  33.45 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4502  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.91 
 
 
810 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  29.53 
 
 
456 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.11 
 
 
822 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.53 
 
 
820 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  31.01 
 
 
465 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1090  aspartate kinase  37.68 
 
 
425 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4435  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.91 
 
 
810 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.941973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3806  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.55 
 
 
811 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4094  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.55 
 
 
811 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0122  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.55 
 
 
811 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  31 
 
 
541 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  32.58 
 
 
463 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0178  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  30.71 
 
 
811 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1634  aspartate kinase I  33.49 
 
 
398 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000370782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>