More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1940 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1940  aspartate kinase I  100 
 
 
408 aa  829    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.604323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3165  aspartate kinase I  66 
 
 
405 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3659  aspartate kinase I  63.39 
 
 
409 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.142763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1067  aspartate kinase I  55.06 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1449  aspartate kinase, monofunctional class  55.01 
 
 
405 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3837  aspartate kinase I  52.21 
 
 
410 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000273355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3651  aspartate kinase I  52.21 
 
 
410 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000595141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3541  aspartate kinase I  52.21 
 
 
410 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.219140000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3811  aspartate kinase I  52.21 
 
 
410 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.6837e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3936  aspartate kinase I  52.21 
 
 
410 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000118555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3847  aspartate kinase I  51.96 
 
 
410 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2452  aspartate kinase I  51.96 
 
 
410 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000398372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3559  aspartate kinase I  51.96 
 
 
410 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3898  aspartate kinase I  51.96 
 
 
410 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3569  aspartate kinase I  51.72 
 
 
410 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000141977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1401  aspartate kinase I  51.72 
 
 
410 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000467314  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1169  aspartate kinase I  54.43 
 
 
415 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000398967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08680  aspartate kinase  51.11 
 
 
401 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2061  aspartate kinase I  53.32 
 
 
417 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1634  aspartate kinase I  50.37 
 
 
398 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000370782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1932  aspartate kinase I  45.77 
 
 
398 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1650  aspartate kinase I  45.77 
 
 
398 aa  359  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1458  aspartate kinase  41.77 
 
 
412 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.901459  normal  0.649763 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  40.29 
 
 
405 aa  269  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  40 
 
 
407 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  40.05 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  40.53 
 
 
410 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  39.81 
 
 
405 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  39 
 
 
427 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  41.55 
 
 
409 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  41.75 
 
 
421 aa  256  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  39.28 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  40.9 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  40.9 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  40.9 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  38.12 
 
 
406 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  41.18 
 
 
420 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  40.1 
 
 
440 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  39.9 
 
 
408 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  39.95 
 
 
421 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  39.39 
 
 
599 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  36.87 
 
 
412 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  39.42 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  40.9 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  39.09 
 
 
414 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  37.8 
 
 
407 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  41.61 
 
 
421 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  38.94 
 
 
409 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  40.38 
 
 
405 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  38.94 
 
 
409 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  38.7 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  38.05 
 
 
601 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3642  aspartate kinase  39.63 
 
 
604 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  39.39 
 
 
599 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  38.7 
 
 
409 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  38.7 
 
 
409 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  39.29 
 
 
421 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  38.46 
 
 
409 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  38.94 
 
 
409 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  38.7 
 
 
409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  38.46 
 
 
409 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  36.45 
 
 
426 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  37.29 
 
 
401 aa  238  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  36.99 
 
 
427 aa  237  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  40.8 
 
 
421 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  40.77 
 
 
424 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  37.59 
 
 
410 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  38.28 
 
 
422 aa  235  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  38.7 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  38.44 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  37.41 
 
 
411 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  39.86 
 
 
422 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  36.88 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  36.88 
 
 
410 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  37.59 
 
 
400 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  38.85 
 
 
423 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  37.59 
 
 
400 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  37.03 
 
 
424 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  34.79 
 
 
720 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  35.04 
 
 
739 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  36.88 
 
 
411 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  39.57 
 
 
423 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  38.85 
 
 
413 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  37.11 
 
 
400 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  37.65 
 
 
413 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  38.57 
 
 
412 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  39.91 
 
 
421 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  38.28 
 
 
599 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  36.94 
 
 
411 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  36.94 
 
 
411 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  37.1 
 
 
434 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  35.19 
 
 
588 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  36.47 
 
 
411 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  34.95 
 
 
588 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  38.7 
 
 
411 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  37.05 
 
 
400 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  36.14 
 
 
406 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  38.95 
 
 
422 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  36.56 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  38.17 
 
 
435 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>