More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1246 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  61.09 
 
 
586 aa  715    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  100 
 
 
588 aa  1189    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0068  aspartate kinase  63.54 
 
 
601 aa  760    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0071  aspartate kinase  64.22 
 
 
601 aa  761    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  61.43 
 
 
586 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17741  aspartate kinase  66.84 
 
 
588 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00821  aspartate kinase  65.13 
 
 
595 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  98.47 
 
 
588 aa  1172    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  61.77 
 
 
586 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  61.09 
 
 
586 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  52.79 
 
 
616 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3642  aspartate kinase  50.67 
 
 
604 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  51.33 
 
 
599 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  50.42 
 
 
601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  51.33 
 
 
599 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  49 
 
 
599 aa  539  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0087  aspartate kinase  49.92 
 
 
604 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  39.18 
 
 
599 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  48.91 
 
 
412 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  48.18 
 
 
405 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  47.64 
 
 
427 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  48.21 
 
 
407 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  49.39 
 
 
406 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  50.85 
 
 
410 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  46.52 
 
 
405 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  46.04 
 
 
405 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  49.88 
 
 
411 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  46.6 
 
 
400 aa  350  3e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  47.2 
 
 
404 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  45.8 
 
 
405 aa  350  5e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1711  aspartate kinase  46.86 
 
 
406 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  48.29 
 
 
400 aa  347  5e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0976  aspartate kinase  46.3 
 
 
408 aa  346  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  45.12 
 
 
401 aa  346  8e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  48.43 
 
 
409 aa  346  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  46.51 
 
 
413 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.8 
 
 
400 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  45.39 
 
 
422 aa  343  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  43.97 
 
 
434 aa  341  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  45.06 
 
 
414 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  44.07 
 
 
411 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  46.34 
 
 
399 aa  340  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  44.07 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  44.07 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  46.49 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  44.31 
 
 
411 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  43.83 
 
 
410 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  44.79 
 
 
412 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  50.61 
 
 
408 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  46.59 
 
 
400 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  44.79 
 
 
412 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  43.83 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  47.82 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  45.69 
 
 
416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  43.96 
 
 
424 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  45.91 
 
 
408 aa  337  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  43.58 
 
 
411 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  43.24 
 
 
409 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  45.85 
 
 
399 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  45.91 
 
 
405 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  44.63 
 
 
411 aa  335  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  45.19 
 
 
410 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  44.04 
 
 
403 aa  333  6e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  47.73 
 
 
410 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  45.3 
 
 
413 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  44.47 
 
 
405 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  47.98 
 
 
409 aa  332  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  48.74 
 
 
409 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  48.48 
 
 
409 aa  329  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  45 
 
 
424 aa  329  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  44.66 
 
 
404 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  42.69 
 
 
408 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  45.43 
 
 
421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  45.76 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  43.37 
 
 
413 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  44.07 
 
 
427 aa  327  3e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  45.76 
 
 
416 aa  327  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  45.63 
 
 
452 aa  327  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  45.3 
 
 
452 aa  326  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  43.94 
 
 
424 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  45.91 
 
 
410 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  45.19 
 
 
424 aa  324  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  47.98 
 
 
409 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0098  aspartate kinase  43.17 
 
 
422 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  44.05 
 
 
421 aa  323  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  43.75 
 
 
405 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  43 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  43.72 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  43.75 
 
 
407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  44.07 
 
 
409 aa  321  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  44.44 
 
 
408 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  44.44 
 
 
408 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  44.55 
 
 
408 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  44.52 
 
 
409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>