More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1317 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  100 
 
 
406 aa  825    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  58.31 
 
 
412 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  61.29 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  59.16 
 
 
405 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  59.5 
 
 
410 aa  448  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  55.75 
 
 
404 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  52.48 
 
 
405 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  52.23 
 
 
405 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  51.73 
 
 
405 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  50.86 
 
 
427 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  50.37 
 
 
410 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  53.6 
 
 
407 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  50.37 
 
 
410 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  52.49 
 
 
407 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  49.88 
 
 
411 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  50.12 
 
 
411 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  49.63 
 
 
411 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  49.88 
 
 
413 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  54.23 
 
 
409 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  50.12 
 
 
411 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  49.63 
 
 
411 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  49.51 
 
 
424 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  52.25 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  52.22 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  51.97 
 
 
409 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  48.65 
 
 
406 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  52.22 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  52.22 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  47.91 
 
 
408 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  51.97 
 
 
409 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  51.97 
 
 
409 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  48.77 
 
 
412 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  49.38 
 
 
427 aa  380  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  50.86 
 
 
417 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  48.77 
 
 
412 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  49.88 
 
 
409 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  51.97 
 
 
409 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  51.23 
 
 
409 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  50.25 
 
 
399 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  51.97 
 
 
409 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  48.89 
 
 
409 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  47.16 
 
 
413 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  50 
 
 
399 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  48.39 
 
 
408 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  48.28 
 
 
414 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  48.39 
 
 
408 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  50.25 
 
 
400 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  50.74 
 
 
400 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  48.64 
 
 
413 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  49.63 
 
 
412 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  50.25 
 
 
400 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  47.91 
 
 
405 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  46.3 
 
 
428 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  49.39 
 
 
588 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  49.25 
 
 
411 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  47.01 
 
 
403 aa  368  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  50 
 
 
409 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  47.92 
 
 
408 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  46.54 
 
 
428 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  47.51 
 
 
400 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  48.91 
 
 
422 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  49.51 
 
 
410 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  46.57 
 
 
408 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  48.16 
 
 
407 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  47.01 
 
 
401 aa  363  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  48.64 
 
 
426 aa  363  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  46.44 
 
 
409 aa  363  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0098  aspartate kinase  49.02 
 
 
422 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  48.66 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  49.39 
 
 
410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  49.39 
 
 
588 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  48.27 
 
 
406 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  47.89 
 
 
405 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  50.12 
 
 
422 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  47.27 
 
 
421 aa  358  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  48.4 
 
 
405 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  48.17 
 
 
404 aa  358  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  50.75 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  49.15 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  46.38 
 
 
406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  48.41 
 
 
421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  46.67 
 
 
422 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  46.43 
 
 
422 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  46.65 
 
 
405 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  47.28 
 
 
414 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  46.67 
 
 
423 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  46.65 
 
 
427 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  47.03 
 
 
416 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  46.06 
 
 
453 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  49.38 
 
 
400 aa  354  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  46.19 
 
 
422 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  47.87 
 
 
435 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  50.12 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  49.38 
 
 
404 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  46.54 
 
 
422 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  46.54 
 
 
422 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  46.27 
 
 
410 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  46.67 
 
 
411 aa  352  7e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  47.92 
 
 
422 aa  352  7e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  46.9 
 
 
422 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>