More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0098 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0098  aspartate kinase  100 
 
 
422 aa  830    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  53.43 
 
 
405 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  53.68 
 
 
405 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  52.94 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  46.31 
 
 
427 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  49.02 
 
 
406 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  50.12 
 
 
405 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  50.86 
 
 
407 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  53.45 
 
 
410 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  53.55 
 
 
408 aa  368  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  48.4 
 
 
411 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  48.16 
 
 
411 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  47.91 
 
 
411 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  47.91 
 
 
410 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  47.91 
 
 
410 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  47.67 
 
 
411 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  47.67 
 
 
411 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  49.51 
 
 
407 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  47.54 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  47.42 
 
 
412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  48.28 
 
 
424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  47.17 
 
 
412 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  48.17 
 
 
413 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  51.49 
 
 
411 aa  355  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  45.83 
 
 
409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  49.28 
 
 
616 aa  350  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  47.77 
 
 
404 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  51.24 
 
 
411 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  47.06 
 
 
413 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  44.61 
 
 
406 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  46.83 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  47.19 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  46.59 
 
 
413 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  51.47 
 
 
417 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  44.63 
 
 
408 aa  342  8e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  45.45 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  47.41 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  48.03 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  48.05 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1246  aspartate kinase  43.17 
 
 
588 aa  339  7e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0595781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  47.55 
 
 
412 aa  338  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21161  aspartate kinase  42.69 
 
 
588 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.926226  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  45.85 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  45.57 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  49.4 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  45.21 
 
 
426 aa  333  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  48.17 
 
 
409 aa  332  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1002  aspartate kinase  43.92 
 
 
400 aa  332  6e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  48.3 
 
 
409 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  42.55 
 
 
428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  48.29 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  45.52 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  45.07 
 
 
405 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  42.79 
 
 
428 aa  328  8e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  47.92 
 
 
411 aa  328  9e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  47.55 
 
 
409 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  48.67 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  47.54 
 
 
409 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  47.13 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  47.04 
 
 
408 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  46.63 
 
 
409 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  46.88 
 
 
409 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  46.06 
 
 
405 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  47.28 
 
 
435 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  46.88 
 
 
409 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  43.95 
 
 
406 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  49.27 
 
 
422 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  46.38 
 
 
409 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  45.32 
 
 
407 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  45.64 
 
 
410 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  47.17 
 
 
414 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  45.26 
 
 
404 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  46.63 
 
 
409 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  46.88 
 
 
409 aa  322  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  46.88 
 
 
409 aa  322  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  47.6 
 
 
424 aa  322  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  42.96 
 
 
401 aa  322  8e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  42.61 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  46.63 
 
 
409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  46.57 
 
 
408 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  46.57 
 
 
408 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  42.96 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  45.13 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  46.56 
 
 
599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  49.39 
 
 
423 aa  319  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  46.13 
 
 
409 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  45.59 
 
 
404 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  47.2 
 
 
423 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  45.23 
 
 
409 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00821  aspartate kinase  45.8 
 
 
595 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0385896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  46.97 
 
 
424 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  43.28 
 
 
408 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  41.94 
 
 
427 aa  316  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2990  aspartate kinase  44.06 
 
 
400 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000125999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  45.81 
 
 
405 aa  316  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  45.7 
 
 
410 aa  316  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  46.51 
 
 
424 aa  316  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18381  aspartate kinase  39.95 
 
 
586 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  47.06 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  40.67 
 
 
586 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>