More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1650 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  100 
 
 
403 aa  812    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  73.95 
 
 
400 aa  599  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  68.24 
 
 
400 aa  551  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  67.74 
 
 
400 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  68.73 
 
 
399 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  67.49 
 
 
400 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  68.49 
 
 
399 aa  547  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  67 
 
 
401 aa  541  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  67.4 
 
 
404 aa  535  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  68.66 
 
 
400 aa  529  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  54.95 
 
 
406 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  57.25 
 
 
405 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  54.48 
 
 
410 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  54.48 
 
 
410 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  54.84 
 
 
412 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  57 
 
 
404 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  54.23 
 
 
411 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  54.84 
 
 
412 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  53.98 
 
 
411 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  57.21 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  58.25 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  55.86 
 
 
408 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  57.07 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  53.48 
 
 
411 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  57.25 
 
 
407 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  55.86 
 
 
408 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  53.23 
 
 
411 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  53.23 
 
 
411 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  53.71 
 
 
409 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  54.21 
 
 
413 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  54.84 
 
 
424 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  52.99 
 
 
413 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  53.98 
 
 
409 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  54.34 
 
 
413 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  53.83 
 
 
408 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  53.23 
 
 
409 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  52.23 
 
 
408 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  55.75 
 
 
404 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  53.2 
 
 
408 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  55.72 
 
 
406 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  53.52 
 
 
411 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  54.48 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  54.11 
 
 
416 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  52.5 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  53.85 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  54.25 
 
 
405 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  54.11 
 
 
406 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  51.24 
 
 
409 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  51.43 
 
 
423 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  49.88 
 
 
407 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  53.71 
 
 
410 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  51.87 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  52.12 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  51.5 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  51.57 
 
 
427 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  50.72 
 
 
428 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  51.12 
 
 
411 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  52.97 
 
 
410 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  51.99 
 
 
405 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  53.45 
 
 
414 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  50.72 
 
 
428 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  52.66 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  52.1 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  53.37 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  52.76 
 
 
422 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  51.67 
 
 
423 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  52.51 
 
 
422 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  51.9 
 
 
423 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  51.62 
 
 
409 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  50.74 
 
 
412 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  51.31 
 
 
422 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  51.61 
 
 
414 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  50.12 
 
 
417 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  52.12 
 
 
407 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  50.5 
 
 
417 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  51.96 
 
 
417 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  50 
 
 
415 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  49.63 
 
 
426 aa  394  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  51.43 
 
 
424 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  51.25 
 
 
405 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  48.63 
 
 
411 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  50.98 
 
 
418 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  51.08 
 
 
422 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  48.5 
 
 
599 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  52.04 
 
 
422 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  52.03 
 
 
423 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  51.79 
 
 
422 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  50.13 
 
 
404 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  50.25 
 
 
412 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  51.79 
 
 
422 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  51.79 
 
 
422 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  51.62 
 
 
410 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1965  aspartate kinase  48.63 
 
 
405 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0866474  hitchhiker  0.000866025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  49 
 
 
412 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  48.64 
 
 
412 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  49.26 
 
 
422 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  49.26 
 
 
412 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.25 
 
 
427 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3519  aspartate kinase  52.49 
 
 
405 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  51.12 
 
 
404 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>