More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2048 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  100 
 
 
409 aa  841    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  77.04 
 
 
408 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  75.55 
 
 
409 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  71.85 
 
 
411 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1705  aspartate kinase  67.48 
 
 
417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.794446  normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  58.87 
 
 
406 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  58.44 
 
 
410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  55.97 
 
 
405 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  56.22 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  56.19 
 
 
404 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  52.48 
 
 
428 aa  448  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  54.48 
 
 
404 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  54.5 
 
 
412 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  54.39 
 
 
411 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  52.96 
 
 
428 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  54.5 
 
 
412 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  55.23 
 
 
424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  55.69 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  55.69 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  54.93 
 
 
409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  53.68 
 
 
408 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  56.22 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  55.47 
 
 
405 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  54.39 
 
 
411 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  53.92 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  54.19 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  53.41 
 
 
411 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  54.61 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  53.41 
 
 
411 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  54.3 
 
 
408 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  54.41 
 
 
416 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  53.41 
 
 
411 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  55.67 
 
 
418 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  52.7 
 
 
413 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  56.79 
 
 
412 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  55.94 
 
 
417 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  54.59 
 
 
410 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  54.03 
 
 
409 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  54.48 
 
 
404 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  54.57 
 
 
409 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  53.92 
 
 
408 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  52.04 
 
 
427 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  53.58 
 
 
408 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  53.58 
 
 
408 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  53.94 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  51.49 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  54.34 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  51.95 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  53.92 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  55.9 
 
 
416 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  52.36 
 
 
400 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  53.07 
 
 
409 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  55.69 
 
 
406 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  52.06 
 
 
414 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  55.42 
 
 
416 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  54.7 
 
 
416 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  54.19 
 
 
410 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  52.93 
 
 
412 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  54.7 
 
 
416 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  54.42 
 
 
419 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  54.7 
 
 
416 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  51.24 
 
 
403 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  53.23 
 
 
412 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  51.08 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  53.35 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  50 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  52.51 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  53.11 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  52.66 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  53.98 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  52.37 
 
 
422 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  53.49 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  51.44 
 
 
417 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  53.49 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  51.77 
 
 
421 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  53.23 
 
 
399 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  53.49 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  52.27 
 
 
422 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  53.49 
 
 
417 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  52.49 
 
 
423 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  53.49 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  53.73 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  52.68 
 
 
412 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  53.49 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  53.49 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  51.79 
 
 
422 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  51.06 
 
 
423 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  52.45 
 
 
417 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  52.25 
 
 
411 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  51.95 
 
 
411 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  52.02 
 
 
422 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  51.55 
 
 
422 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>