More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1871 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  85.58 
 
 
424 aa  738    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  100 
 
 
423 aa  860    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  84.93 
 
 
419 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  85.34 
 
 
424 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  88.65 
 
 
424 aa  755    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  87.47 
 
 
424 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  96.45 
 
 
423 aa  835    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  77.54 
 
 
417 aa  673    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  99.76 
 
 
423 aa  858    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  71.9 
 
 
419 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  69.58 
 
 
419 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  68.4 
 
 
411 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  67.92 
 
 
411 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  68.16 
 
 
411 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  68 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  68.4 
 
 
411 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  68.71 
 
 
417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  67.77 
 
 
405 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  66.98 
 
 
411 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  68.31 
 
 
417 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  66.98 
 
 
411 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  67.22 
 
 
411 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  67.92 
 
 
418 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  66.35 
 
 
406 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  69.25 
 
 
417 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  68.78 
 
 
417 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  69.25 
 
 
417 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  69.72 
 
 
417 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  61.83 
 
 
418 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  60.71 
 
 
417 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  60.33 
 
 
412 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  60.32 
 
 
419 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  60.09 
 
 
419 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  60.32 
 
 
419 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  59.2 
 
 
415 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  60.42 
 
 
418 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  60.09 
 
 
418 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  58.69 
 
 
412 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  59.39 
 
 
412 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  58.92 
 
 
415 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  52.96 
 
 
418 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  51.64 
 
 
428 aa  418  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  53.66 
 
 
410 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  52.25 
 
 
404 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  51.54 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  52.26 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  52.71 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  51.99 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  52.26 
 
 
405 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  50.71 
 
 
406 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  51.67 
 
 
403 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  54.35 
 
 
416 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  54.12 
 
 
416 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  52.96 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  52.01 
 
 
411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  52.72 
 
 
410 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  52.01 
 
 
411 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  52.72 
 
 
410 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  52.72 
 
 
424 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  51.78 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  51.42 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  51.77 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  52.94 
 
 
416 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  50.59 
 
 
408 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  51.31 
 
 
404 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  53.08 
 
 
416 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  52.94 
 
 
416 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  49.29 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  51.43 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  51.89 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  51.3 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  51.77 
 
 
413 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  52.01 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  50.59 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  52.47 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  51.65 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.37 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  52.47 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.37 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  53.66 
 
 
409 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  50.95 
 
 
400 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  52.47 
 
 
417 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  51.9 
 
 
410 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  52.47 
 
 
417 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  52.47 
 
 
417 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  52.47 
 
 
417 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  53.88 
 
 
416 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  49.53 
 
 
409 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  50.24 
 
 
400 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  50 
 
 
401 aa  395  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  50.23 
 
 
422 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  52.83 
 
 
453 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  51.53 
 
 
421 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  53.18 
 
 
416 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>