More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1934 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0636  aspartate kinase  77.8 
 
 		 419 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  82.52 
 
 		 412 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1934  aspartate kinase  100 
 
 		 412 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.167611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2061  aspartokinase  83.01 
 
 		 412 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.227299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1849  aspartate kinase  77.09 
 
 		 419 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0498  aspartate kinase  77.09 
 
 		 419 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366794  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0862  aspartate kinase  76.74 
 
 		 418 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  61.65 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3526  aspartate kinase  60.33 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0891  aspartate kinase  60.92 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1034  aspartate kinase  59.39 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2504  aspartate kinase  59.95 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  61.56 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0135  aspartate kinase  60.39 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0420777  normal  0.197945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4746  aspartate kinase  60.14 
 
 		 411 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0110  aspartate kinase  59.9 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0370  aspartate kinase  59.67 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0379  aspartate kinase  60.05 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2625  aspartate kinase  60.99 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3001  aspartate kinase  58.92 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1802  aspartate kinase  59.62 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0701255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0958  aspartate kinase  58.45 
 
 		 411 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.859872  normal  0.0328142 
 
 
-
 
NC_004310  BR1871  aspartate kinase  59.39 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0896  aspartate kinase  58.94 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.434223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  59.38 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3818  aspartate kinase  60.81 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0472  aspartate kinase  59.09 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0132  aspartate kinase  59.62 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0921  aspartate kinase  58.45 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3957  aspartate kinase  60.42 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7602  aspartate kinase  59.76 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.221383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1562  aspartate kinase  60.29 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0077  aspartate kinase  58.61 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.0840427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  57.93 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0099  aspartate kinase  58.85 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.211168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0950  aspartate kinase  59.14 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0514  aspartate kinase  57.66 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0514405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0608  aspartate kinase  58.37 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2144  aspartate kinase  56.35 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0884042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  54.96 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  53.28 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3304  aspartate kinase  54.18 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0250326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  56.59 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  53.27 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  53.04 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  50.71 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  50.71 
 
 		 428 aa  418  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  55.75 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  52.7 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  52.93 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  53.06 
 
 		 405 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  53.17 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  53.83 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  53.04 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.78 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  53.94 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  53.79 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  53.14 
 
 		 408 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  51.82 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  52.8 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  53.59 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  52.07 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  53.06 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  52.26 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  52.07 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  53.46 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  53.06 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  53.25 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  53.53 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  52.68 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  52.68 
 
 		 409 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  52.58 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  53.06 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  53.46 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  53.35 
 
 		 416 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  52.8 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  53.04 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  53.46 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  54.85 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  54.78 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  51.77 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  54.55 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  51.21 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  54.55 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  51.21 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  55.5 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  52.98 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  51.9 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  52.87 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  51.06 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  51.29 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  52.74 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  53.19 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>