More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1167 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  100 
 
 
412 aa  839    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  68.08 
 
 
404 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  64.37 
 
 
410 aa  519  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  64.53 
 
 
408 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  62.34 
 
 
405 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  57.78 
 
 
427 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  58.31 
 
 
406 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  53.62 
 
 
405 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  53.62 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  53.12 
 
 
405 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  60 
 
 
409 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  52.97 
 
 
406 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  49.88 
 
 
434 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  53.37 
 
 
407 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  54.48 
 
 
410 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  53.81 
 
 
408 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  52.05 
 
 
421 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  53.19 
 
 
407 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  52.24 
 
 
427 aa  420  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  52.05 
 
 
421 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  52.24 
 
 
426 aa  420  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  52.05 
 
 
421 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  52.97 
 
 
409 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  52.36 
 
 
411 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1145  aspartate kinase  54.2 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  53.71 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  51.8 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  51.68 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  52.36 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  49.88 
 
 
435 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  51.67 
 
 
424 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  52.11 
 
 
410 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  52.99 
 
 
399 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  52.61 
 
 
411 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  52.23 
 
 
408 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  52.36 
 
 
411 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  50.62 
 
 
400 aa  411  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  53.37 
 
 
421 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  51.44 
 
 
440 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  51.86 
 
 
410 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  50.96 
 
 
421 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1001  aspartate kinase  53.25 
 
 
616 aa  408  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  52.48 
 
 
412 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  52.24 
 
 
399 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  52.15 
 
 
424 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  52.11 
 
 
411 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  52.48 
 
 
412 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  52.52 
 
 
422 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  50.24 
 
 
422 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1175  aspartate kinase  54.68 
 
 
599 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  52.23 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3642  aspartate kinase  53.21 
 
 
604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.685027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3243  aspartate kinase  53.44 
 
 
601 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  53.87 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  52.04 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  49.38 
 
 
599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  51.37 
 
 
405 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  52.63 
 
 
423 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  50.75 
 
 
401 aa  402  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  49 
 
 
403 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  52.49 
 
 
404 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  52.46 
 
 
413 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  53.3 
 
 
410 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  51.11 
 
 
422 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  52.71 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  50.37 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  50.62 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  50.62 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  52.22 
 
 
408 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  52.16 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  52.22 
 
 
408 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  53.48 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  48.8 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2221  aspartate kinase  52.51 
 
 
599 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  52.25 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  51.54 
 
 
452 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  49.76 
 
 
423 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  48.32 
 
 
428 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  51.36 
 
 
413 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  52.35 
 
 
408 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  51.09 
 
 
422 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  51.68 
 
 
421 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  50 
 
 
446 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18571  aspartate kinase  48.46 
 
 
586 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  50.36 
 
 
424 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  51.66 
 
 
452 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  50.99 
 
 
411 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  51.13 
 
 
409 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02610  aspartate kinase  50.59 
 
 
428 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  50.12 
 
 
421 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  51.32 
 
 
421 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  49.28 
 
 
421 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  49.63 
 
 
413 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1740  aspartate kinase  48.55 
 
 
586 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  51.23 
 
 
409 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  51.84 
 
 
422 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  50.25 
 
 
409 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18381  aspartate kinase  48.79 
 
 
586 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  50.88 
 
 
409 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  51.12 
 
 
407 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>