More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1006 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  76.79 
 
 		 405 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  100 
 
 		 410 aa  831    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  76.79 
 
 		 407 aa  630  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  76.79 
 
 		 405 aa  628  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  74.32 
 
 		 405 aa  614  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  74.5 
 
 		 404 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  73.63 
 
 		 404 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  70.65 
 
 		 404 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  62.04 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  62.87 
 
 		 410 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  62.87 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  62.04 
 
 		 411 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  62.53 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  62.04 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  62.04 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  61.89 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  61.89 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  62.14 
 
 		 424 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  63.05 
 
 		 406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  63.64 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  58.49 
 
 		 428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  58.49 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  61.99 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  61.33 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  65.02 
 
 		 406 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  62.32 
 
 		 409 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  64.2 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  62.01 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  61.71 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  60.05 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  61.19 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  57.92 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  61.12 
 
 		 409 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  62.01 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  61.92 
 
 		 409 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  61.79 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  61.79 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  58.44 
 
 		 409 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  61.48 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  60.55 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  60.48 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  56.74 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  61.03 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  60.71 
 
 		 453 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  58.81 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  59.19 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  60.25 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  59.38 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  60.24 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  60.48 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  60.24 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  59.76 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  60.48 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  59.28 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  60.89 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  60.1 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  59.28 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  59.95 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  57.25 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  60.96 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  59.28 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  59.28 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  59.28 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  58.91 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  59.43 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  60.55 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  58.8 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  58.71 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  59.55 
 
 		 405 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  58.87 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  58.19 
 
 		 422 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1705  aspartate kinase  55.99 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.794446  normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  58.19 
 
 		 422 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  58.43 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  58.8 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  58.37 
 
 		 410 aa  464  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1743  aspartate kinase  57.55 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557086  normal  0.669364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  59.04 
 
 		 416 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  58.21 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  59.52 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000735102  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  57.71 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  57.21 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  57.21 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  56.72 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  57.96 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  59.06 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  55.09 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  58.8 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  57.21 
 
 		 401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  57.43 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  58.31 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  60.1 
 
 		 416 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3191  aspartate kinase  53.9 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>