More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3600 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3600  aspartate kinase  100 
 
 		 404 aa  822    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000134751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  62.75 
 
 		 409 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  53.1 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  54.11 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  52.49 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  50 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  49.75 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  49.88 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  52.84 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  52.85 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  49.75 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  48.75 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1430  aspartate kinase  51.88 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.039188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  49.25 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  49.13 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  48.51 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  48.88 
 
 		 399 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1883  aspartate kinase  50.88 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  48.26 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1857  aspartate kinase  50.88 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.974180000000001e-30 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  48.26 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  48.14 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  48.13 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1676  aspartate kinase  50.63 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1623  aspartate kinase  50.63 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3521  aspartate kinase  51.13 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  49.63 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1811  aspartate kinase  50.63 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.172065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  50.37 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1932  aspartate kinase  50.63 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1821  aspartate kinase  50.38 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.529675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1658  aspartate kinase  50.38 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  53.48 
 
 		 408 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  48.76 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  47.28 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  47.52 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  48.02 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1675  aspartate kinase  49.87 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  49.13 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  48.27 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  48.02 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  47.01 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  48.14 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1317  aspartate kinase  49.38 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.573615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  48.27 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  48.64 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  50.12 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  46.8 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  48.28 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  49.13 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  46.88 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  48.39 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  48.51 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  49.38 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  50.12 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  49.38 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  46.87 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  49.38 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  49.38 
 
 		 412 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  46.87 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  49.63 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  45.65 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  49.13 
 
 		 410 aa  362  6e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1230  aspartate kinase  50.62 
 
 		 411 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  47.71 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  48.39 
 
 		 409 aa  362  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  46.4 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  45.41 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  50 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  45.93 
 
 		 422 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  46.62 
 
 		 405 aa  359  6e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  47.3 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  47.3 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  47.3 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  50 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  47.13 
 
 		 422 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  47.13 
 
 		 422 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  46.81 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  47.13 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  48.64 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  49.01 
 
 		 410 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  45.22 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  46.51 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  49.88 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  47.63 
 
 		 409 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  45.43 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  47.58 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  48.88 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  47.34 
 
 		 416 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  47.34 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  48.07 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  46.75 
 
 		 422 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  47.63 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3014  aspartate kinase  48.4 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000193467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>