More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  100 
 
 		 435 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  79.36 
 
 		 434 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  79.31 
 
 		 424 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  78.9 
 
 		 421 aa  646    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  71.56 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  71.26 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  71.56 
 
 		 424 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  69.5 
 
 		 422 aa  589  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  72.25 
 
 		 424 aa  584  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  70.18 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  70.28 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  67.89 
 
 		 422 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  67.43 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  67.2 
 
 		 423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  67.59 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  69.27 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  68.74 
 
 		 452 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  67.59 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  67.66 
 
 		 423 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  69.04 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  67.13 
 
 		 421 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  65.98 
 
 		 421 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  68.58 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  65.29 
 
 		 421 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  62.99 
 
 		 421 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  62.76 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  61.84 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  61.84 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  61.84 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  64.37 
 
 		 421 aa  534  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  61.61 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  65.06 
 
 		 421 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28320  aspartate kinase  64.69 
 
 		 455 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  62.3 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02610  aspartate kinase  64.6 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  56.94 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  51.76 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19620  aspartate kinase  53.83 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863794 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  50.94 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  51.42 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  50.47 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  51.76 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  52.59 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  49.88 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  51.99 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  51.42 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  50.24 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  51.18 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  49.41 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  49.41 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  49.65 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  49.88 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  48.6 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  50.35 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  49.88 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  48.71 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  51.76 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  47.64 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  50.12 
 
 		 408 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  51.76 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  50.94 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  51.64 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  49.65 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  48.94 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  49.42 
 
 		 412 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  49.42 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  50.47 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  48.22 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  47.98 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  51.18 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  50.7 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  50.36 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  50 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  46.43 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  51.17 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  54.22 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  47.88 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  45.95 
 
 		 403 aa  385  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  48.24 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  48.72 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  49.17 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  50.6 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  49.76 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  47.98 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  49.05 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  48.22 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  50.6 
 
 		 410 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  46.68 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  49.76 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1425  aspartate kinase  48.22 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  47.03 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  48.58 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  50.47 
 
 		 409 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  44.81 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  47.39 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  51.78 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  45.77 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  47.27 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  45.71 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  46.92 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>