More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0462 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0462  aspartate kinase  100 
 
 
421 aa  848    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  87.65 
 
 
421 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  82.42 
 
 
421 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0694  aspartate kinase  77.67 
 
 
421 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0217  aspartate kinase  75.77 
 
 
421 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13741  aspartate kinase  81.71 
 
 
421 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.500059  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  82.42 
 
 
421 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1304  aspartate kinase  82.19 
 
 
440 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.928497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36380  aspartate kinase  76.72 
 
 
420 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.881518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  82.42 
 
 
421 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  82.9 
 
 
421 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0493  aspartate kinase  73.4 
 
 
421 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.481845  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0226  aspartate kinase  74.35 
 
 
421 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0265  aspartate kinase  74.11 
 
 
421 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.472998  hitchhiker  0.00161342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0504  aspartate kinase  72.75 
 
 
422 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4886  aspartate kinase  70.62 
 
 
422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9311  Aspartate kinase  70.28 
 
 
424 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202676  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3528  aspartate kinase  68.87 
 
 
424 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305275  normal  0.739035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0262  aspartate kinase  72.51 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6573  aspartate kinase  72.27 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0282  aspartate kinase  65.9 
 
 
434 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2012  aspartate kinase  68.08 
 
 
422 aa  568  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.506578  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0321  aspartate kinase  68.38 
 
 
424 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.559818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04740  aspartate kinase  65.98 
 
 
435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.356353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0463  aspartate kinase  68.6 
 
 
446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0043  aspartate kinase  68.79 
 
 
423 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4813  aspartate kinase  67.14 
 
 
423 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9025  aspartate kinase  68.25 
 
 
422 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0419  aspartate kinase  64.62 
 
 
424 aa  547  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3119  aspartate kinase  67.77 
 
 
421 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0552  aspartate kinase  65.02 
 
 
452 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0689  aspartate kinase  64.32 
 
 
452 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0559  aspartate kinase  63.44 
 
 
424 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02610  aspartate kinase  61.45 
 
 
428 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28320  aspartate kinase  56.8 
 
 
455 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0111  aspartate kinase  57.42 
 
 
411 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19620  aspartate kinase  51.13 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1167  aspartate kinase  52.16 
 
 
412 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000835866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1378  aspartate kinase  51.23 
 
 
405 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000455127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1515  aspartate kinase, monofunctional class  51.47 
 
 
405 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1370  aspartate kinase  51.46 
 
 
407 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2117  aspartate kinase  54.17 
 
 
404 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.203177 
 
 
-
 
NC_002936  DET1633  aspartate kinase  50.74 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000255158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  50.61 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  51.6 
 
 
427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  51.21 
 
 
405 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  52.09 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  50.74 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  53.27 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  53.27 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  48.89 
 
 
411 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  48.89 
 
 
411 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  49.26 
 
 
424 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  48.65 
 
 
411 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  48.4 
 
 
410 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  48.16 
 
 
411 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  48.4 
 
 
410 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5290  aspartate kinase  56.22 
 
 
415 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  50.24 
 
 
416 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  48.4 
 
 
412 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  48.65 
 
 
412 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  47.79 
 
 
406 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  50.73 
 
 
405 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  50.61 
 
 
409 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  47.2 
 
 
408 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  49.39 
 
 
408 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  48.67 
 
 
411 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  49.63 
 
 
401 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  47.1 
 
 
428 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  48.17 
 
 
413 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  50.72 
 
 
412 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  50 
 
 
409 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1075  aspartate kinase  51.72 
 
 
410 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  50 
 
 
407 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  50.12 
 
 
416 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  53.56 
 
 
409 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  49.75 
 
 
414 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  46.64 
 
 
428 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  47.41 
 
 
400 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0884  aspartate kinase  53.83 
 
 
408 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000337521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  48.04 
 
 
427 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  46.93 
 
 
413 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  49.63 
 
 
410 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  49.51 
 
 
405 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  46.67 
 
 
403 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  50.37 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1304  aspartate kinase  50.24 
 
 
405 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.506172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  49.63 
 
 
404 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0574  aspartate kinase  45.95 
 
 
407 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  49.76 
 
 
414 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  49.15 
 
 
406 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  47.16 
 
 
400 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  48.66 
 
 
408 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  49.38 
 
 
411 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  48.9 
 
 
404 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000021173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  48.69 
 
 
422 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  49.88 
 
 
410 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  49.14 
 
 
409 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  46.67 
 
 
400 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  49.63 
 
 
410 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>