31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1480 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1480  hicA protein  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  63.1 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  76.47 
 
 		 68 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  59.52 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  54.76 
 
 		 113 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  71.19 
 
 		 59 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  51.19 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  46.99 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  47.62 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  41.46 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  41.46 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  40.24 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  39.29 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  36.9 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  35.71 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  35.71 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  38.16 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  45.28 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  36.36 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  28.92 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  37.88 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  38.1 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  36.36 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  30.38 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  27.06 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3122  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000156322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>