17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2667 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  100 
 
 
83 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  76.83 
 
 
82 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  61.25 
 
 
81 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  62.5 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0281  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.098703  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0432  hypothetical protein  42.5 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  40 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  36.36 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  35.82 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  35.38 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  32.93 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  35.37 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  32.93 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  35.37 
 
 
84 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  39.34 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  34.15 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>