28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4137 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  76.47 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  83.05 
 
 		 59 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  64.71 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  63.08 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  63.08 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  51.56 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  46.77 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  49.23 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  45.45 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  46.15 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  46.77 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  40.62 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  51.02 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  43.08 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  40.91 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  40 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  40.91 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  40.91 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  34.38 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  33.82 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  37.7 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  35.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  35.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  39.06 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  32.81 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>