32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0021 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  100 
 
 		 88 aa  183  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  71.95 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  60.24 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  51.81 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  54.22 
 
 		 84 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  46.99 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  51.81 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  46.34 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  46.99 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  49.4 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  45.12 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  45.12 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  41.46 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  43.37 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  40.24 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  48.57 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  41.46 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  39.02 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  46.77 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  49.12 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  26.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  34.33 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  43.14 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  34.15 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  37.5 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  31.71 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  35.94 
 
 		 81 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>