27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1109 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  100 
 
 		 76 aa  154  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  75 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  64.47 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  63.16 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  64.38 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  64.38 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  58.57 
 
 		 85 aa  87.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  47.14 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  55.71 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  48.57 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  48.68 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  46.05 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  45.21 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  46.97 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  38.16 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  38.57 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  39.47 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  37.68 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  39.68 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  44.07 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  41.67 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  30.3 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>