28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0422 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  100 
 
 
84 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  100 
 
 
84 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  69.05 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  67.86 
 
 
84 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  65.48 
 
 
96 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  64.38 
 
 
76 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  54.88 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  51.19 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  47.62 
 
 
84 aa  84.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  48.81 
 
 
84 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  45.12 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  45.12 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  45.24 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  40.96 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  40.48 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  40.48 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  40.96 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  35.71 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  31.17 
 
 
92 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  34.15 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  28.24 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  31.71 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  33.77 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  38.98 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  32.43 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3122  hypothetical protein  31.48 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000156322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>