31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0060 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  63.1 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  65.48 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  61.9 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  57.14 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  54.76 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  56.79 
 
 		 97 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  67.8 
 
 		 59 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  50.6 
 
 		 85 aa  87.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  48.19 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  45.78 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  46.99 
 
 		 83 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  45.24 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  45.24 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  45.24 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  44.05 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  44.05 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  42.86 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  43.37 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  45.21 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  51.85 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  34.15 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  35.37 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  36.9 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  35.62 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  36.99 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  35.82 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  27.06 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  35.37 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  29.82 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>