17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1651 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  34.09 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  34.52 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  32.94 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  32.94 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  26.51 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  28.24 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  28.24 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  28.24 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  26.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  26.74 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  25.88 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  28.24 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  27.06 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  28.92 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  28.24 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  27.06 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>