16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4478 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  100 
 
 		 81 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  88.89 
 
 		 81 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  61.25 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  56.25 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  36.36 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  35.9 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  33.85 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0281  hypothetical protein  38.82 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.098703  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0432  hypothetical protein  39.24 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  42.11 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  37.5 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  34.38 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  33.82 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>