27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4241 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  83.05 
 
 		 68 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  71.19 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  67.8 
 
 		 84 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  59.32 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  62.71 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  57.14 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  49.12 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  49.12 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  50.85 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  47.46 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  49.12 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  41.82 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  45.28 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  44.07 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  44.07 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  37.29 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2667  HicA protein  39.34 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4478  HicA protein  42.11 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  38.98 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  38.98 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  40.68 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4585  HicA protein  42.11 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3900  hicA protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  38.6 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  40.68 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  36.84 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>