28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2592 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  100 
 
 		 89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  72.62 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  72.62 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  69.05 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  69.05 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  63.16 
 
 		 76 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  56.63 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  50.6 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  51.81 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  48.81 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  46.43 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  48.19 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  39.29 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  40.24 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  37.8 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  33.8 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  32.53 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  32.93 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1651  hypothetical protein  28.24 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  33.82 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  32.89 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  31.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3122  hypothetical protein  28.33 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000156322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  38.6 
 
 		 59 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>