27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3198 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  100 
 
 
93 aa  189  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  51.81 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  50.6 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  51.19 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  51.19 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  54.22 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  53.01 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  46.99 
 
 
88 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  48.19 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  48.19 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  45.78 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  55.71 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  44.05 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  40.86 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  43.37 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  36.9 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  40.96 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  37.35 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  40.24 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  36.9 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  36.05 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  34.94 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  43.08 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  32.91 
 
 
92 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  44.07 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3122  hypothetical protein  32.79 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000156322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>