18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3854 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3854  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  49.06 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  45.28 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  48.15 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4241  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4137  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  45.1 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  41.67 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  43.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  37.25 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  38.89 
 
 		 84 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  37.04 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  39.22 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  41.18 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  35.19 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  35.19 
 
 		 92 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>