21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1668 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1668  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107995  normal  0.325968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  38.55 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  41.46 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  41.46 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  40.24 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  36.59 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  33.73 
 
 
88 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  37.8 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  41.46 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  34.94 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  36.05 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  39.02 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  36.59 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  34.15 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  34.15 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  36.9 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  38.27 
 
 
97 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1480  hicA protein  34.15 
 
 
84 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.521208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  34.15 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  34.15 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  30 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>