20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0257 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0257  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  191  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1717  hypothetical protein  33.75 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00490607  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  41.56 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  38.96 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  28.92 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  28.75 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  33.8 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  29.41 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0622  hypothetical protein  32.93 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.595418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  31.17 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  31.17 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  37.33 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0512  hypothetical protein  27.71 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  32.91 
 
 
93 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4181  hypothetical protein  30.23 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.259511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5180  hypothetical protein  31.33 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0179  HicA protein  27.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1109  HicA-related protein  30.3 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3742  hypothetical protein  17.5 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0060  hypothetical protein  29.82 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>