61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0286 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09561  hypothetical protein  93.44 
 
 		 549 aa  953    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.241955  normal  0.10067 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0286  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  100 
 
 		 549 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19601  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14261  glycosyltransferase  35.41 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259667  hitchhiker  0.00324745 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16111  hypothetical protein  33.4 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  26.89 
 
 		 544 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  33.03 
 
 		 580 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1311  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  27.78 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0736647  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14321  hypothetical protein  28.85 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16761  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransferase  31.75 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.4 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  25.33 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  29.93 
 
 		 466 aa  57  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.29 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  26.21 
 
 		 564 aa  54.3  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.36 
 
 		 546 aa  53.5  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.87 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  22.17 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.57 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.87 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.57 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.57 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.87 
 
 		 549 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 514 aa  50.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.27 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  25.49 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.62 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.53 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.9 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 666 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 522 aa  48.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.69 
 
 		 556 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  25.55 
 
 		 323 aa  47  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  28.68 
 
 		 561 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  24.6 
 
 		 563 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  37.11 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  22.5 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  26.56 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  25.87 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.32 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 463 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3121  glycosyl transferase family 39  20.92 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  30.88 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  22.47 
 
 		 611 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.73 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.73 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.73 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.73 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  27.01 
 
 		 540 aa  44.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  34.41 
 
 		 493 aa  44.3  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  31.82 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  30.3 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.03 
 
 		 541 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.88 
 
 		 568 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 557 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>