32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83842 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_83842  conerved hypothetical protein with WD repeats  100 
 
 		 514 aa  1061    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03737  WD repeat-containing protein AN3737 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6U3]  33.98 
 
 		 525 aa  279  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33241  predicted protein  25.81 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0310383  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03070  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36668  predicted protein  27.89 
 
 		 579 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  28.93 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  30.77 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33300  predicted protein  34.21 
 
 		 331 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00310  rRNA processing protein Pwp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02630)  29.51 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.584247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1190 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 		 1193 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 		 1411 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  26.9 
 
 		 884 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.04 
 
 		 930 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05593  F-box and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11440)  23.46 
 
 		 854 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  26.11 
 
 		 308 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43856  predicted protein  26.6 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.796398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1657 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.16 
 
 		 1330 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1196 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  27.97 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.58 
 
 		 1652 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.11 
 
 		 1623 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.36 
 
 		 1609 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  25.14 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.12 
 
 		 1240 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12589  predicted protein  26.32 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.44 
 
 		 344 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.94 
 
 		 1004 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.76 
 
 		 1188 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.48 
 
 		 1267 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>