19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36668 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36668  predicted protein  100 
 
 
579 aa  1199    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33241  predicted protein  30.77 
 
 
505 aa  140  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0310383  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83842  conerved hypothetical protein with WD repeats  27.89 
 
 
514 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03737  WD repeat-containing protein AN3737 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6U3]  28.69 
 
 
525 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03070  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
595 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.86 
 
 
1039 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.12 
 
 
1831 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  23.73 
 
 
1041 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  25.94 
 
 
618 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.69 
 
 
1262 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.8 
 
 
729 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.79 
 
 
1856 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 
1807 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.67 
 
 
1599 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 
1344 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31512  predicted protein  25.37 
 
 
538 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268234  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  24.26 
 
 
505 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  24.71 
 
 
495 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.74 
 
 
1652 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>