206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81500 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81500  ubiquinol-cytochrome c reductase core subunit 1  100 
 
 
445 aa  899    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00747  Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  34.02 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0838506  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00860  mitochondrial processing peptidase beta subunit, mitochondrial precursor (beta-mpp), putative  33.11 
 
 
477 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0244089  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36688  mitochondrial processing protease  29.69 
 
 
465 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0178117  normal  0.476468 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29535  predicted protein  29.18 
 
 
436 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00887655 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20787  predicted protein  27.23 
 
 
473 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0430146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  26.11 
 
 
431 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  26.18 
 
 
431 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  27 
 
 
419 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  26.13 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  26.75 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  26.49 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  25.65 
 
 
421 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  24.7 
 
 
421 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  24.19 
 
 
421 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  25.86 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  26.12 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  25.06 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  26.08 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  25.53 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 
429 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  25.69 
 
 
429 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  25.19 
 
 
421 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  24.06 
 
 
434 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  25.74 
 
 
421 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  25.52 
 
 
419 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  25.74 
 
 
429 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  22.67 
 
 
418 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  21.85 
 
 
430 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  23.19 
 
 
429 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  24.44 
 
 
429 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  22.73 
 
 
432 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  23.38 
 
 
421 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  21.43 
 
 
430 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  24.87 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  21.14 
 
 
430 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  25.31 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  22.84 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  23.06 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  20.9 
 
 
422 aa  94  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  24.5 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  22.04 
 
 
434 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  22.49 
 
 
432 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  21.15 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  22.51 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  20.7 
 
 
439 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  24.58 
 
 
462 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 
435 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  22.46 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  23.69 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_51888  predicted protein  26.46 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0830441  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  22.09 
 
 
432 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  21.46 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  23.11 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  20.47 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  21.62 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  24.47 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  22.2 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  22.01 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  23.99 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2190  peptidase M16 domain-containing protein  27.76 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  21.31 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  19.9 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  21.87 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  23.47 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  22.46 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  22.33 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  22.22 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  21.58 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  21.32 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  21.32 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  21.32 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  21.32 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  21.22 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2761  peptidase M16 domain-containing protein  21.03 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  21.32 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  21.32 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  21.32 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  21.32 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  21.87 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  21.58 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  21.27 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  22.84 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  21.93 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  22.63 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  18.96 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2291  peptidase M16 domain-containing protein  26.96 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  20.43 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  22.2 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3015  peptidase M16 domain-containing protein  22.59 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  22.08 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  21.91 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  21.58 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  21.84 
 
 
412 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  19.65 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  18.88 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  21.74 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  22.43 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  20.78 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  20.71 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>