30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57811 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  100 
 
 
424 aa  859    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  48.57 
 
 
555 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  42.55 
 
 
511 aa  322  8e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  31.09 
 
 
594 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  27.35 
 
 
647 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  25.11 
 
 
449 aa  114  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  25.13 
 
 
529 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  24.41 
 
 
472 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  23.96 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  21.82 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  24.23 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  21.64 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  22.68 
 
 
589 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  22.71 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  23.03 
 
 
584 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  21.64 
 
 
744 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  22.91 
 
 
501 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  22.05 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  24.01 
 
 
618 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  21.8 
 
 
509 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  21.96 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  22.17 
 
 
505 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  22.49 
 
 
551 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  24.8 
 
 
739 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  21.74 
 
 
538 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  21.29 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  18.38 
 
 
564 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  20.3 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  23.1 
 
 
670 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  20.82 
 
 
819 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>