21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50072 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  100 
 
 
505 aa  1005    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50146  predicted protein  57.21 
 
 
589 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50071  predicted protein  54.59 
 
 
501 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0530284  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  46.07 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  47.56 
 
 
437 aa  356  5e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48637  predicted protein  42.16 
 
 
551 aa  286  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48219  predicted protein  39.37 
 
 
480 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289088  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  34.23 
 
 
509 aa  237  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43280  predicted protein  27.11 
 
 
528 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0677337  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  25.67 
 
 
555 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  22.03 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  25.23 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  22.98 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  20.7 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  23.89 
 
 
449 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  24.11 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  23.2 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  22.25 
 
 
594 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  21.69 
 
 
598 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  22.42 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60861  predicted protein  22.62 
 
 
544 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78945  normal  0.726976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>