23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45709 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  100 
 
 
472 aa  954    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  42.95 
 
 
449 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  38.93 
 
 
448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  37.45 
 
 
482 aa  260  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  23.31 
 
 
584 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  24.76 
 
 
555 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  25.38 
 
 
529 aa  97.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  25.07 
 
 
564 aa  93.2  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  24.41 
 
 
424 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  22.57 
 
 
594 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  23.95 
 
 
647 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  22.91 
 
 
618 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  21.43 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  23.03 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  24.21 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45824  predicted protein  18.07 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122291  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  22.42 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49391  predicted protein  22.82 
 
 
538 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  23.03 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  21.65 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_25632  AAAP family transporter: amino acid  23.64 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  20 
 
 
605 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>