20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_79777 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  100 
 
 
598 aa  1209    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60861  predicted protein  34.27 
 
 
544 aa  252  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78945  normal  0.726976 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08854  amino acid transporter (Eurofung)  28.45 
 
 
451 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
525 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00050  amino acid transporter, putative  34.27 
 
 
801 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  25.37 
 
 
474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  24.62 
 
 
393 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  23.22 
 
 
670 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02020  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 
481 aa  61.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  23.24 
 
 
505 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  21.14 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  20.95 
 
 
501 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  22.58 
 
 
819 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50072  predicted protein  21.5 
 
 
505 aa  50.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.955215  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45969  predicted protein  24.2 
 
 
509 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  23.03 
 
 
472 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  21.59 
 
 
621 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47781  predicted protein  23.94 
 
 
437 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.938739  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  22.4 
 
 
739 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  20.31 
 
 
511 aa  43.9  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>