20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06100 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  100 
 
 
819 aa  1668    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  47.42 
 
 
739 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  44.14 
 
 
580 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  41.4 
 
 
670 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  35.41 
 
 
621 aa  328  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  27.12 
 
 
605 aa  130  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  25.53 
 
 
501 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39978  predicted protein  26.42 
 
 
688 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  21.72 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45824  predicted protein  22.4 
 
 
580 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122291  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  22.89 
 
 
744 aa  60.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  21.46 
 
 
598 aa  55.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 
525 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  20.33 
 
 
424 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  22.7 
 
 
511 aa  47.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  23.36 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  22.03 
 
 
584 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08026  amino acid transporter (Eurofung)  22.16 
 
 
452 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0778229 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  30 
 
 
474 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  21.88 
 
 
594 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>