14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03550 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1062    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00050  amino acid transporter, putative  31.88 
 
 
801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  34.46 
 
 
598 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60861  predicted protein  28.46 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78945  normal  0.726976 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08854  amino acid transporter (Eurofung)  31.23 
 
 
451 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  24.13 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  26.01 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14597  AAAP family transporter: amino acid  33.64 
 
 
380 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.47156  normal  0.0353558 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 
511 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  21.74 
 
 
555 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  19.94 
 
 
819 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  19.84 
 
 
584 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49985  predicted protein  21.6 
 
 
505 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  26.14 
 
 
594 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>